ortologi

Установка базы данных изложена в файле инструкции.ipynb.

Основные зависимости для установки базы данных:

• https://pandas.pydata.org/
• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK179288/
• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/docs/v2/reference-docs/command-line/datasets/
• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279690/

Зависимости главного алгоритма (файл yml):

• https://networkx.org/
• https://github.com/guyallard/markov_clustering
• https://biopython.org/
• https://pyvis.readthedocs.io/
• https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279690/